Référent en biologie de synthèse au plan national et international, impliqué dans plusieurs projets européens dans ce domaine, François Képès est directeur de recherche au CNRS, et professeur invité permanent à l'Imperial College, à Londres. Il est co-fondateur et directeur du Programme d'Épigénomique à Genopole®. Il est aussi membre associé du Centre de Recherche en Épistémologie Appliquée de l'École Polytechnique.