Charles Habonimana est né au Rwanda en 1982. Lui et sa sœur aînée sont les seuls survivants de leur famille, massacrée lors du génocide perpétré contre les Tutsi. Militant des droits de l'homme, Charles Habonimana a dirigé le Groupe des Anciens Etudiants Rescapés du Génocide (GAERG) au Rwanda de 2012 à 2016. Il a participé à de nombreuses conférences internationales sur la prévention du génocide, la réconciliation et la justice.