Annie Floc’hlay est médecin. De 1992 à 2007 elle a exercé à l’Éducation nationale auprès des élèves dans les écoles et établissements de deux départements. De 2007 à 2013 puis de 2016 à 2024 elle a occupé les fonctions de médecin conseiller technique départemental, responsable d’un service médical en faveur des élèves, dans deux directions académiques.