Comme les deux précédents, le douzième volume des registres du Consistoire de Genève, qui comprend quasi toute l’année 1557, révèle la croissance soutenue du pouvoir de Calvin et du Consistoire. Ce volume plus long que les précédents signale d’emblée l’intensification des efforts disciplinaires de l’institution. Ce n’est qu’en 1556 que Calvin et les autres assistants reçoivent le droit de faire prêter serment aux témoins; l’année suivante, le Consistoire engage pour la première fois des poursuites pour faux témoignage. Le Consistoire continue à lutter contre la fainéantise et le vagabondage, alors que les autorités manifestent une inquiétude grandissante au sujet de la dissipation des biens. En parallèle, la paillardise demeure un des délits les plus souvent poursuivis. Calvin et ses collègues condamnent la violence conjugale, mais les hommes reconnus coupables ne reçoivent généralement que des remontrances. Le Consistoire jouit du droit exclusif d’excommunier, et ceux qui sont exclus de la Cène doivent demander leur réadmission à la communion dans l’intervalle d'une année sous peine d’être bannis.